U.S. Truppen werden in einen Konflikt zwischen der Regierung Ost-Timors und indonesischen Partisanen verwickelt. Der Anführer dieser Gruppierung, Suhadi Sadono, ist unauffindbar.
Sam Fisher, der allein agierende Spezialagent ist - mit Unterstützung eines vom Einsatzort entfernt agierenden Teams - im Einsatz für Third Echelon, einer streng geheimen Sektion der NSA (National Security Agency). Seine Aufgabe ist keine geringere als die Rettung der Welt. Im Falle des Scheiterns wird die Regierung jegliches Wissen über seine Existenz abstreiten.
Fisher muss dem U.S. Militär den Rücken frei halten, bis Sadono und die Guerillas neutralisiert sind.
Produkteigenschaften
Komplett neue Dschungelmissionen: Der Spieler muss Sam Fishers gesamtes Repertoire an Geheim-Manövern in detailreich gestalteten Umgebungen des indonesischen Dschungels einsetzen, um vor seinen Gegnern unentdeckt zu bleiben.
Missionsstatistik und -nachbesprechung: Nach jeder Mission erhält der Spieler Auskunft über seine Leistung, von der Anzahl abgegebener Schüsse bis hin zur Zahl neutralisierter Gegner und Spielzeit eines Levels.
Neue alternative Routen beim wiederholten Spielen von Missionen: Missionsziele können auf unterschiedlichen Wegen erreicht werden. Jede neue Route bietet ihre eigenen Herausforderungen und Belohnungen.
Neue Spielmechanik bei Sprengfallen: Explosive Vorrichtungen werden durch neues Vorgehen - vergleichbar mit der Benutzung des Dietrichs - deaktiviert.